第1話“挑戰(zhàn)太陽的人”
為追求蘊藏著強大力量的“賢者之石”而持續(xù)旅行的艾爾利克兄弟,哥哥愛德華,是史上最年輕獲得國家煉金術(shù)師資格的天才煉金術(shù)師,弟弟阿爾馮斯,雖然外表是壯碩盔甲姿態(tài),事實上是個非常溫柔體貼的少年。來到東方邊境的小鎮(zhèn)里歐爾的兩人,在那里他們目擊了自稱為太陽神雷特代理人,柯奈洛教主的“奇跡之術(shù)”。
第2話“禁忌的身體”
因關(guān)系到“賢者之石”,艾爾利克兄弟在里歐爾教會的秘密地下室與柯奈洛教主對決。但是卻遭到察覺教主有危機的雷特教信徒們打斷。兩人雖然逃到街上,但卻被信仰深厚的里歐爾鎮(zhèn)民發(fā)現(xiàn)并包圍。因“奇跡之術(shù)”而動起來的雷特神像,致使阿爾被破壞、愛德被逮捕,并且被拖到柯奈洛的面前。
第3話“母親…”
在旅途中順路繞進的街角舊書店里,找到了煉金術(shù)入門書的愛德和阿爾,回想起了閱讀這本書學習時的往事。那是在兩人還很幼小的時候,在故鄉(xiāng)利賽布爾村生活的事。他們想看到母親開心的笑容,為了這個單純的心愿,兩人開始爭相學習煉金術(shù)。
第4話“愛的煉成”
為了成為國家煉金術(shù)師,艾爾利克兄弟離開故鄉(xiāng)利賽布爾出外旅行。旅途中聽到煉金術(shù)師馬吉哈魯?shù)膫髀劊巴煸L其居住的村莊,但那個村子卻傳出死人復活陸續(xù)攻擊活人的不祥謠言。
第5話“疾走!機械鎧!”
為了成為國家煉金術(shù)師,愛德華與阿爾朝向中央市前進。當打電話向馬斯坦中校報告自己即將到達的消息時,出乎意料的被命令搭上下一班列車。于是兩人遂急忙跳上指定的火車。沒想到,與家人出來旅行的哈克洛將軍正好也在該列車上。
第6話“國家煉金術(shù)師資格考試”
為了準備國家煉金術(shù)師資格考試,愛德華與阿爾住進了由馬斯坦介紹的,生物體煉成界的第一人“綴命之煉金術(shù)師”修?塔卡的家中。受到塔卡的女兒妮娜與愛犬亞歷山大的鼓勵,兄弟倆每天都埋首苦讀。然后,考試當天,愛德華與阿爾前去應(yīng)考了。 第7話“合成獸慟哭之夜”
愛德華以12歲的年紀通過“國家煉金術(shù)師資格考試”的試驗,成為了史上最年輕的合格者,并從馬斯坦手中接下了作為國家煉金術(shù)師證明的銀懷表。然后塔卡家舉辦了慶祝派對,妮娜與亞歷山大玩得不亦樂乎。但塔卡此時卻為了即將到了的審定日子,被逼入了絕境。
第8話“賢者之石”
愛德華沒能解救妮娜,內(nèi)心備受后悔與無力感的煎熬。馬斯坦此時卻命令愛德華去分析塔卡留下的研究,愛德華對這樣“冷酷”的命令感到非常憤怒,一個人獨自開始搜索殺害妮娜的犯人。
第9話“軍隊走狗的銀懷表”
感受到自己的渺小與無力,為了要達成自己的目的,愛德華決意成為國家煉金術(shù)師,但在得到種種特權(quán)的同時,也意味著將成為“軍方的走狗”。隨后,愛德華接到了馬斯坦所下達的身為國家煉金術(shù)師的第一個任務(wù)。
第10話“怪盜賽壬”
在前往和馬斯坦做報告的途中,兄弟倆在水之都阿庫羅亞中途下車。阿庫羅亞是有名的觀光勝地,但最近卻有位名叫“賽壬”的怪盜出沒。該人身份不明,唯一的線索只有這家伙會使用煉金術(shù)。兄弟二人接受了街上刑警的委托,協(xié)助幫忙尋找怪盜。
第11話“砂礫的大地·前篇”
聽到“賢者之石”的傳言,愛德華與阿爾來到了黃金的產(chǎn)地杰諾塔姆。這里曾是繁極一時的城鎮(zhèn),不知從何時開始漸漸沒落下來,于是鎮(zhèn)民們便把最后的希望寄托在馬古瓦爾所研究的“賢者之石”之上。而愛德華與阿爾在那里得知了冒牌艾爾利克兄弟的存在。
第12話“砂礫的大地·后篇”
瑟爾和弗雷查打著艾爾利克兄弟的名號,繼續(xù)從事著“賢者之石”的研究。為了從“紅水”中精制出“賢者之石”,拉瑟爾依照馬古瓦爾的指示實行了某個方法,但最后由于他們實在無法狠下心來實行,遂被逮捕到地下牢房。 第13話“焰 VS 鋼”
身為國家煉金術(shù)師必須提出調(diào)查報告,為了這個目的,愛德華與阿爾馮斯來到了東方司令部。當愛德華尋問馬斯坦自己在杰諾塔姆所聽到的關(guān)于馬可醫(yī)生謠言時,卻被巧妙地避開了話題。于是愛德華心生一計,決定以馬可的情報為賭注,向馬斯坦提出了模擬戰(zhàn)斗的要求。
第14話“破壞的右手”
過去在伊修巴爾內(nèi)戰(zhàn)中從軍方脫逃的前國家煉金術(shù)師馬可醫(yī)生。兄弟二人為了拜訪這位“賢者之石”的研究者,來到了海德村。愛德華要求馬可讓自己看當初從軍方帶走的“賢者之石”的研究資料。
第15話“伊修巴爾大屠殺”
遭到斯卡追殺的愛德華與阿爾,在千鈞一發(fā)之際被阿姆斯特朗解救,并帶著馬可一起逃命。當馬可知道斯卡是伊修巴爾人之后,便開始談起過去發(fā)生的那場戰(zhàn)爭,伊修巴爾內(nèi)亂凄慘的事實真相。
第16話“失去的東西”
為了修理被斯卡破壞的機械鎧,愛德華與阿爾和隨身保護他們的阿姆斯特朗一同前往利賽布爾。馬可秘密給予的紙條中,記載著“賢者之石”相關(guān)研究資料的藏匿處,中央圖書館第一分館。為了好不容易掌握到的“賢者之石”線索,兩人又再度出發(fā)。
第17話“有家人等待的家”
為了修理機械鎧,愛德華、阿爾與阿姆斯特朗回到了利賽布爾。自從放火燒掉自己的家,開始旅行尋找“賢者之石”的那一天起,這是四年來第一次返鄉(xiāng)。比拿可與溫莉雖然講話刻薄,但還是很溫馨地迎接二人的歸來。
第18話“馬可手記”
為了得到馬可留下的“賢者之石”研究資料,愛德華與阿爾再度造訪中央市。然而資料的保管地點中央圖書館第一分館確早已因火災而焚毀,根據(jù)目擊者的證言推測,犯人是斯卡。
第19話“真相中的真相”
為了取回失去的一切,艾爾利克兄弟長久以來追求的“賢者之石”,那是犧牲許多人的生命才制造出來的東西。這個沖擊性的事實真相幾乎讓愛德華崩潰,但是他還是決定要探究馬可留下的筆記“真實的深處的深處”的真意。
第20話“守護者的靈魂”
愛德華與阿爾查出了“賢者之石”的研究場所是第五研究所。這個本來應(yīng)該已成廢墟的這個地方,卻有著重重戒備與無數(shù)的機關(guān)。而此時出現(xiàn)了襲擊愛德華與阿爾的兩個黑影,死刑犯48號與66號。
第21話“紅色光芒”
愛德華與48號的死斗在第五研究所展開,圍繞著“賢者之石”的情報,緊湊而無法喘息的一進一退攻防戰(zhàn)持續(xù)進行著。另一方面在研究所的中庭,阿爾馮斯與66號的心理層面戰(zhàn)斗也即將開始。
第22話“被造出的人類”
愛德華終于闖進第五研究所的深處。為了將煉金術(shù)轉(zhuǎn)用于軍事用途,這個地方曾經(jīng)進行了大規(guī)模的生物體煉成研究,研究所內(nèi)仍存在著大量未完成的“賢者之石”與巨大的煉成陣。此時塔卡向愛德華提議,利用這些材料來完成“賢者之石”。
第23話“鋼鐵之心”
傷痕累累的愛德華,意識朦朧地在醫(yī)院病床上醒過來。而阿爾則是身體幾近半壞的狀態(tài)下,被放在房間的角落。只差一步就可以得到“賢者之石”,但怎么也無法跨出那一步,這件事束縛著愛德的心。而阿爾與66號交手之后,就一直抱持著某個疑問。
第24話“回憶的固定”
自己的靈魂說不定也是偽造的,被這個疑問所困擾的阿爾,從愛德的面前逃開。茫然佇立于街頭的他,在那里遇到了伊修巴爾人的少年兄弟雷歐與利克。阿爾在兄弟倆的帶領(lǐng)下造訪伊修巴爾的秘密營地,在那里他遇見了意想不到的人物。 第25話“別離的儀式”
雖然在第五研究所獲知了賢者之石的真相,愛德華與阿爾還是決定另尋他法來恢復原本擁有的身體。二人為了追求那個可能性,決定離開中央市。另一方面,持續(xù)調(diào)查第五研究所與賢者之石的休斯,最后發(fā)現(xiàn)到了某件事實。
第26話“她的理由”
愛德華、阿爾以及溫莉三人來到了機械鎧圣地拉修巴雷。面對街上一排排的機械鎧工作室,溫莉顯得極為興奮。三人在拉修巴雷特有的機械鎧腕力大賽中,遇到了右手腕與雙足都是機械鎧的少女帕妮娘。
第27話“師父”
愛德華與阿爾兩人在拉修巴雷被他們最害怕的人煉金術(shù)師父伊茲米逮到。愛德華成為“軍方的走狗”國家煉金術(shù)師一事令伊茲米氣得怒火攻心,于是將兩人拉往達普利斯。另一方面,東方司令部的馬斯坦這邊,收到了調(diào)往中央市的正式公文。
第28話“一即是全、全即是一”
“現(xiàn)在的他們所需要的是偶爾停下來好好思考?!币疗澝自俅螌鄣氯A與阿爾兩人帶到約克島。那里是二人年幼時期為了修行所待過的地方。島上還殘留著好幾處當時所留下的痕跡,二人一邊回憶著過去一邊重新檢視自己。
第29話“無垢的孩子”
愛德華與阿爾在約克島一邊回憶往事,一邊懺悔自己犯下的過錯,并下定決心為了挽回一切,要繼續(xù)前進。此時,應(yīng)該沒有任何人在的森林里,出現(xiàn)了一名使用著煉金術(shù)的神秘少年。
第30話“南方司令部襲擊”
伊茲米從約克島帶回的少年,少年右肩上有道舊傷痕,那道傷痕和愛德華幼年在約克島修行時所受的傷痕非常相似,少年在愛德華的逼問下逃走了。另一方面,休斯的繼任者法蘭克·亞伽中校陪伴阿姆斯特朗少校搜索著愛德華等人的下落,來到了達普利斯。
第31話“罪”
右足擁有銜尾蛇紋章的少年,為了爭奪此人,軍方、金布利、艾爾利克兄弟、以及伊茲米等眾人在南方司令部僵持不下。另一方面,馬斯坦奉大總統(tǒng)之命,為了逮捕斯卡,率領(lǐng)軍隊到齊修亞近郊的貧民窟。
第32話“深林中的但丁”
擁有愛德華失去的右手腕與左腳的少年拉斯,他是過去伊茲米進行人體煉成后失敗的結(jié)果,被創(chuàng)造出來的人造人。拉斯期望可以成為人類,為了搶奪剩余的身體而襲擊愛德。
第33話“被囚禁的阿爾”
在伊茲米師父的但丁之館,阿爾遭到格利德率領(lǐng)的合成獸軍團襲擊,被強行擄走。阿爾被囚禁在他們的根據(jù)地,郊區(qū)的酒吧惡魔之巢,在那里,格利德逼問阿爾關(guān)于永遠的生命的秘密。
第34話“貪婪的理論”
在惡魔之巢展開了不穩(wěn)份子的殲滅作戰(zhàn),亞伽隊的士兵接二連三地射殺著格利德一派的合成獸,在混戰(zhàn)之中,格利德遭到金布利與塔卡的背叛,又受到拉絲特、格拉托尼的襲擊,漸漸被逼入絕境。
第35話“愚者的再會”
拉絲特偶然遇見了知道她的過去的青年路瓊。二年前,為了找出流行于故鄉(xiāng)村落的原因不明的怪病“化石病”的治療方法,路瓊?cè)找岳^夜拼命地研究煉金術(shù)。
第36話“我心中的罪人”
在南部邊境地帶,愛德與阿爾接觸了被軍方護送的伊修巴爾人,得知有位老人知道有關(guān)于過去伊修巴爾曾經(jīng)制造過“賢者之石”的事。愛德、阿爾以及溫莉,遂前往老人所居住的,位在齊修亞西邊的貧民窟。
第37話“焰之煉金術(shù)師……”
哈勃克少尉奉軍內(nèi)務(wù)課之命對馬斯坦上校進行監(jiān)視,他和布萊達、法爾曼、菲利一起秘密寫下《羅伊·馬斯坦觀察日記》。陸續(xù)揭開的馬斯坦上校那鮮為人知的日常生活。 第38話“隨川而流”
在前往伊修巴爾的旅行途中,愛德與阿爾為了是要以阻止斯卡為優(yōu)先,還是恢復自己的身體為優(yōu)先而意見不合。另一方,在休斯的墳前,謝絲卡和溫莉偶然相遇,獨自調(diào)查休斯事件的謝絲卡,終于歸納出了一個假設(shè)。
第39話“東方內(nèi)戰(zhàn)”
旅行途中,瑪黛兒向愛德華和阿爾道出自己與多魯契德、羅亞等人在特殊部隊服役時的過去。伊修巴爾內(nèi)戰(zhàn)的真相和第五研究所的真實在此漸漸明朗化。就在此時,為了鎮(zhèn)壓反抗勢力,亞伽率領(lǐng)的軍隊到達了里歐爾鎮(zhèn)。
第40話“傷痕”
金布利背叛格利德并出賣同伴,倒戈重返軍方。為了替同伴報仇,瑪黛兒不顧阿爾的制止,猛然地發(fā)動了攻擊。另一方面,愛德和斯卡在里歐爾鎮(zhèn)對峙著。
第41話“圣母”
失去了領(lǐng)導者,里歐爾陷入一片混亂,趁著這股混亂,軍方?jīng)Q定使用武力進行軍事鎮(zhèn)壓,軍方的鎮(zhèn)壓部隊向市區(qū)進軍。而斯卡則企圖利用里歐爾的混亂來完成賢者之石。
第42話“不知其名”
追求賢者之石的人必定招來滅亡的傳說,再次因為一個名為里歐爾的城鎮(zhèn)的犧牲而誕生。奉大總統(tǒng)的特別命令,金布利率領(lǐng)合成獸部隊進攻里歐爾的市區(qū),但是在他的面前,立誓為伊修巴爾復仇的斯卡堵住了他的去路。
第43話“野狗出逃”
突然從里歐爾的市街消失的愛德與阿爾。軍方與人造人追逐逼近著成為“賢者之石”的阿爾。在這局勢下,愛德與阿爾,向著利賽布爾的方向繼續(xù)逃亡。
第44話“光之霍恩海姆”
藏身在利賽布爾的愛德與阿爾的面前,出現(xiàn)了一位意外的人物。那是他們十幾年前就拋家不知去向的父親,霍恩海姆。
第45話“劣化心靈之物”
中央市舊市街,在那地下延伸的巨大都市遺跡的一角。光之霍恩海姆與但丁相對而見,兩人之間有著永遠糾纏不清的緣份。事情回溯到四百年前,從他們終于抵達的那一天開始。
第46話“人體煉成”
決意要和人造人決一死戰(zhàn)的愛德,為了拿到拉斯的弱點而去拜訪了伊茲米。另一方面,被留下的阿爾,為了知道賢者之石的用法而去了某個地方,那里就是修?塔卡的秘密藏身之處。
第47話“封印人造人”
為了解救成為賢者之石的阿爾,愛德與斯洛斯兩人僵持對峙。阿爾在斯洛斯的身上仍感受到母親的殘影,而被困惑著。犯下的罪,真正的贖罪是要親手消除罪孽,愛德現(xiàn)在,挺身對抗斯洛斯。
第48話“后會有期”
愛德將斯洛斯的構(gòu)成物質(zhì)全部轉(zhuǎn)換成乙醇,那是觸犯禁忌者的,所無法避免的一條路。另一方,被送往北方的部隊,飄蕩著詭異的氣氛。 第49話“到門的另一側(cè)”
為了追上被帶走的阿爾,愛德只身前往中央市。在那里從重逢的托林卡姆兄弟口中得知,在第五研究所前面,有個與“賢者之石”相關(guān)的巨大研究場。
第50話“死”
被經(jīng)由羅珊的嬰兒所出現(xiàn)的門所吞沒的愛德,被飛送到了門的另一邊的世界。那里是20世紀初的倫敦。在混亂中,愛德拼命逃離了齊柏林飛艇。此時,但丁命令格拉托尼吃掉阿爾,想要得到完全的賢者之石。
第51話“慕尼黑1921”
馬斯坦先是在大總統(tǒng)府與普萊德對立,接著又和知曉事態(tài)而趕來的亞伽對峙。另一方面,在但丁的大宅里,恩維為了見霍恩海姆而消失到門的里面。最后愛德為了喚回最重要的東西,再度拍擊雙掌。