高度重復序列是一組基因序列,在基因組中重復頻率高,可達百萬(106)以上,因此復性速度很快。在基因組中所占比例隨種屬而異,約占10-60%,在人基因組中約占20%。

中文名

高度重復序列

對象

基因組

次數(shù)

百萬

所占比例

20%

結(jié)構(gòu)特點

倒位(反向)重復序列

這種重復順序復性速度極快,即使在極稀的DNA濃度下,也能很快復性,因此又稱零時復性部分,約占人基因組的5%。反向重復序列由兩個相同順序的互補拷貝在同一DNA鏈上反向排列而成。變性后再復性時,同一條鏈內(nèi)的互補的拷貝可以形成鏈內(nèi)堿基配對,形成發(fā)夾式或“+”字形結(jié)構(gòu)。倒位重復(即兩個互補拷貝)間可有一到幾個核苷酸的間隔,也可以沒有間隔。沒有間隔的又稱回文(palimdr-ome),這種結(jié)構(gòu)約占所有倒位重復的三分之一。若以兩個互補拷貝組成的倒位重復為一個單位,則倒位重復的單位約長300bp或略少。兩個單位之間有一平均1.6kb的片段相隔,兩對倒位重復單位之間的平均距離約12kb,亦即它們多數(shù)散布非群集于基因組中。

衛(wèi)星DNA

衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)是另一類高度重復序列,這類重復順序的重復單位一般由2-10bp組成,成串排列。由于這類序列的堿基組成不同于其他部份,可用等密度梯度離心法將其與主體DNA分開,因而稱為衛(wèi)星DNA或隨體DNA。在人細胞組中衛(wèi)星DNA約占5-6%。按照它們的浮力密度不同,人的衛(wèi)星DNA可分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四種。果蠅的衛(wèi)星DNA順序已經(jīng)搞清楚,可分為三類,這三類衛(wèi)星DNA都是由7bp組成的高度重復順序:衛(wèi)星Ⅰ為5'ACAACT3',衛(wèi)星Ⅱ為5'ACAAATT3'。而蟹的衛(wèi)星DNA為只有AT兩個堿基的重復順序組成。

重復結(jié)構(gòu)

這種重復順序為靈長類所獨有。用限制性內(nèi)切酶HindⅢ消化非洲綠猴DNA,可以得到重復單位為172bp的高度重復順序,這種順序大部份由交替變化的嘌呤和嘧啶組成。有人把這類稱為α衛(wèi)星DNA。而人的α衛(wèi)星DNA更為復雜,含有多順序家族。

功能

a.參與復制水平的調(diào)節(jié)反向序列常存在于DNA復制起點區(qū)的附近。另外,許多反向重復序列是一些蛋白質(zhì)(包括酶)和DNA的結(jié)合位點。

b.參與基因表達的調(diào)控DNA的重復順序可以轉(zhuǎn)錄到核內(nèi)不均一RNA分子中,而有些反向重復順序可以形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),這對穩(wěn)定RNA分子,免遭分解有重要作用.

c.參與轉(zhuǎn)位作用幾乎所有轉(zhuǎn)位因子的末端都包括反向重復順序,長度由幾個bp到1400bp。由于這種順序可以形成回文結(jié)構(gòu),因此在轉(zhuǎn)位作用中即能連接非同源的基因,又可以被參與轉(zhuǎn)位的特異酶所識別。

d.與進化有關(guān)不同種屬的高度重復順序的核苷酸序列不同,具有種屬特異性,但相近種屬又有相似性。如人的α衛(wèi)星DNA長度僅差1個堿基(前者為171bp,后者為172bp),而且堿基序列有65%是相同的,這表明它們來自共同的祖先。在進化中某些特殊區(qū)段保守的,而其他區(qū)域的堿基序列則累積著變化。

e.同一種屬中不同個體的高度重復順序的重復次數(shù)不一樣,這可以作為每一個體的特征,即DNA指紋。

f.α衛(wèi)星DNA成簇的分布在染色體著絲粒附近,可能與染色體減數(shù)分裂時染色體配對有關(guān),即同源染色體之間的聯(lián)會可能依賴于具有染色體專一性的特定衛(wèi)星DNA順序。?