固相雜交是將待測 的靶核苷酸鏈預(yù)先固定在固體支持物上,而 標(biāo)記的探針則游離在溶液中,進(jìn)行雜交反應(yīng) 后,使雜交分子留在支持物上,故稱固相雜 交。該方法的優(yōu)點(diǎn)是通過漂洗能將未雜交的游 離探針除去,留在膜上的雜交分子容易被檢 測,能防止靶DNA的自我復(fù)性。固體支持物 種類較多,有硝酸纖維素膜、尼龍膜、化學(xué)激 活膜、乳膠顆粒、磁珠和微孔板等,以前兩種 最為常用。常用的固相雜交類型有菌落雜交、斑點(diǎn)雜交、印跡雜交、印跡 雜交、組織原位雜交等。

特點(diǎn)

固相雜交讀取光密度值。結(jié)果應(yīng)用本方法對血清中丙型肝炎病毒核酸檢測,靈敏度可達(dá)5拷貝~50拷貝/反應(yīng)。結(jié)論此方法簡便,快速,特異性好,敏感性高,結(jié)果判定指標(biāo)客觀

相關(guān)資料

雜交反應(yīng)的條件類似于傳統(tǒng)的Southern或Northern雜交。具體的選擇視研究目的而定,例如,進(jìn)行多態(tài)性分析或雜交測序時,要求能夠區(qū)分單個堿基的變異,所以需要較高的雜交嚴(yán)謹(jǐn)性;而用于表達(dá)譜檢測的芯片為了提高檢測的特異性、保證較高的靈敏度,需要較長的雜交時間,高的嚴(yán)謹(jǐn)性、高的樣品濃度、較低的雜交溫度等。同時,雜交反應(yīng)還必需考慮反應(yīng)液中的鹽濃度、探針序列的G+C含量、探針?biāo)鶐щ姾汕闆r、探針與芯片片基間連接臂的長度及種類,靶序列二級結(jié)構(gòu)等因素。固定于芯片表面的探針或蛋白、多肽分子與位于液相的靶分子進(jìn)行生化反應(yīng)(作用)的過程不完全與液相中生化反應(yīng)相同。其原因在于,生物大分子與固相支持物的結(jié)合導(dǎo)致了溶液中的靶分子與其不能迅速地發(fā)生作用,延長了反應(yīng)時間,必要時還必需提高靶分子的濃度以加快反應(yīng)。而且,固相化的大分子,特別是空間體積較小的分子,很容易受到支持物對生化反應(yīng)的空間阻礙作用。如何解決以上問題是生物芯片技術(shù)應(yīng)用中的關(guān)鍵之一。有研究表明[2,3],在探針分子與片基間加入適當(dāng)長度的連接臂可使雜交效率提高上百倍。連接臂將固相化的探針分子與支持物隔開一定的距離,減少空間阻礙作用。另外,不帶電荷的肽核酸(PNA)也可與DNA形成PNA-DNA雜交體,且比DNA-DNA或DNA-RNA雜交體更為穩(wěn)定的,防止核酸二級結(jié)構(gòu)對雜交反應(yīng)的影響,所以適合進(jìn)行單個堿基錯配的分析。PNA還能夠抵御蛋白酶與核酸酶的降解,具有很高的穩(wěn)定性。目前由于PNA合成難度較大、成本高尚未得到大量的應(yīng)用。為加快雜交反應(yīng)速度,美國Nanogen公司研制的電子芯片通過在雜交位點(diǎn)引如電場而使雜交和沖洗過程速度大大增加。它在1mm2的位點(diǎn)上制作有微電極陣列(圖1.),其上覆以鏈親和素標(biāo)記的瓊脂糖[5,6]。生物素標(biāo)記的探針分子可快速地結(jié)合到位于電極上方的瓊脂糖上,從而提高了雜交速度。其原理為:當(dāng)位于待檢位點(diǎn)鏈親和素標(biāo)記的瓊脂糖凝膠下方的微電極引入直流正電壓后,溶液中的生物素標(biāo)記化的探針就可在電場的作用下快速泳動并濃縮結(jié)合于該處。同樣的道理,可以使待檢的DNA分子快速濃縮于此,從而有力地雜交反應(yīng)迅速進(jìn)行。雜交完成后,改變電場方向、可將未雜交的樣品DNA從檢測位點(diǎn)“洗”去,選擇適當(dāng)?shù)碾妶鰪?qiáng)度就可以使非特異雜交的DNA與未雜交的探針選擇性地從特定位點(diǎn)分開除去,而保留完全雜交的DNA分子。由于電場的這種濃縮和選擇特性,使得該方法有很高的靈敏度和特異性,最重要的是它使原來數(shù)小時的雜交反應(yīng)縮短到二三十秒鐘。GeneLogic公司研制的生物芯片將探針分子固定與微通道內(nèi),標(biāo)記后的核酸樣品流過時便會濃縮富集于通道內(nèi),同樣也可縮短雜交過程,提高檢測的靈敏度,降低試劑消耗[8,9]。