小進(jìn)化（小進(jìn)化）

概述

小進(jìn)化

進(jìn)化思想的發(fā)展

關(guān)于萬物互相轉(zhuǎn)化和演變的自然觀可以追溯到人類文明的早期。例如，中國《易經(jīng)》中的“陰陽”、“八卦”說，把自然界還原為天、地、雷、風(fēng)、水、火、山、澤八種基本現(xiàn)象，并試圖用“陰陽”、“八卦”來解釋物質(zhì)世界復(fù)雜變化的規(guī)律。古希臘阿那克西曼德（約公元前6世紀(jì)）認(rèn)為生命最初由海中軟泥產(chǎn)生，原始的水生生物經(jīng)過蛻變（類似昆蟲幼蟲的蛻皮）而變?yōu)殛懙厣铩＿@可能是世界上最早的關(guān)于生命起源和演變的假說。

中世紀(jì)的西方，基督教圣經(jīng)把世界萬物描寫成上帝的特殊創(chuàng)造物。這就是所謂“特創(chuàng)論”。與特創(chuàng)論相伴隨的目的論則認(rèn)為自然界的安排是有目的性的，“根據(jù)這種理論，貓被創(chuàng)造出來是為了吃老鼠，老鼠被創(chuàng)造出來是為了給貓吃，而整個自然界創(chuàng)造出來是為了證明造物主的智慧”（恩格斯：《自然辯證法》·導(dǎo)言）。

從15世紀(jì)后半葉的“文藝復(fù)興”到18世紀(jì)，是近代自然科學(xué)形成和發(fā)展的時期。這個時期在科學(xué)界占統(tǒng)治地位的觀點是不變論。當(dāng)時這種觀點被I·牛頓和C·von林奈表達(dá)為科學(xué)的規(guī)律：地球由于所謂“第一推動力”而運轉(zhuǎn)起來，以后就永遠(yuǎn)不變地運動下去，生物種原來是這樣，現(xiàn)在和將來也是這樣。到了18世紀(jì)下半葉，自然科學(xué)的發(fā)展不斷與這種不變觀點相沖突。I·康德的“天體論”首先在不變論自然觀上打開了第一個缺口；隨后，“轉(zhuǎn)變論”的自然觀就在自然科學(xué)各領(lǐng)域中逐漸形成。這個時期的一些著名的生物學(xué)家，往往在兩種思想觀點中徬徨。例如林奈晚年在其名著《自然系統(tǒng)》一書中刪去了物種不變的詞句；法國生物學(xué)家G·L·de布豐雖然把“轉(zhuǎn)變論”帶進(jìn)了生物學(xué)，但他一生都在“轉(zhuǎn)變論”和“不變論”之間徘徊。J·B·de拉馬克在 1809年出版的《動物哲學(xué)》一書中詳細(xì)闡述了他的生物轉(zhuǎn)變論觀點，并且始終沒有動搖。

中國自漢、唐以來，隨著農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥的發(fā)展，對生命自然現(xiàn)象的解釋也出現(xiàn)過不少關(guān)于物種可變的描述和“轉(zhuǎn)變論”的觀點。例如北魏賈思勰（6世紀(jì)）在《齊民要術(shù)》中，唐郭橐駝在《種樹書》中，明末來應(yīng)星在《天工開物》中都有關(guān)于動植物通過雜交或植物通過嫁接而引起變異的描述。唐顏真卿（ 8世紀(jì)）、北宋沈括（11世紀(jì)）都根據(jù)“滄海桑田”的觀點對化石的成因作過正確的解釋。

英國地質(zhì)學(xué)家 C．萊爾在 19世紀(jì)早期首先將“轉(zhuǎn)變論”帶進(jìn)地質(zhì)學(xué)。他以對現(xiàn)代地殼狀態(tài)的觀察結(jié)果來推論古代的地質(zhì)現(xiàn)象，認(rèn)為地球經(jīng)歷了緩慢、漸進(jìn)的變化。這種看法被稱為均變論。反之，法國古生物學(xué)家G．居維葉則提出災(zāi)變論。認(rèn)為生物的改變是突然的，每次全部消失之后又全部被重新創(chuàng)造出來。他認(rèn)為地球經(jīng)歷了多次這樣的災(zāi)變。

18世紀(jì)末到19世紀(jì)后期，大多數(shù)動植物學(xué)家都沒有認(rèn)真地研究生物進(jìn)化，而且偏離了古希臘唯物主義傳統(tǒng)，墜入唯心主義。這個時期的一些進(jìn)化理論多半是臆測的，這些理論雖然承認(rèn)生物種可以轉(zhuǎn)變（所以仍屬于“轉(zhuǎn)變論”范疇）但把進(jìn)化原因歸于非物質(zhì)的內(nèi)在力量，如“活力”或“活的驅(qū)動”等?；盍φ撜J(rèn)為是生物的“內(nèi)部的力量”即活力驅(qū)動著生物的進(jìn)化，使之越來越復(fù)雜完善。但活力論缺乏實際的證據(jù)，是一種唯心的臆測。最有名的活力論者就是法國生物學(xué)家拉馬克。19世紀(jì)后期出現(xiàn)的“終極目的論”或“直生論”，認(rèn)為生物進(jìn)化有一個既定的路線和方向而不論外界環(huán)境如何變化（例如馬始終按身體由小變大、齒冠由低變高以及由趾變?yōu)樘愕穆肪€發(fā)展進(jìn)化）。古生物學(xué)家T．艾默、H．F．奧斯本等是直生論的著名代表。

進(jìn)化學(xué)說

后人把拉馬克對生物進(jìn)化的看法稱為拉馬克學(xué)說或拉馬克主義，其主要觀點是：①物種是可變的，物種是由變異的個體組成的群體；②在自然界的生物中存在著由簡單到復(fù)雜的一系列等級（階梯），生物本身存在著一種內(nèi)在的“意志力量”驅(qū)動著生物由低的等級向較高的等級發(fā)展變化；③生物對環(huán)境有巨大的適應(yīng)能力；環(huán)境的變化會引起生物的變化，生物會由此改進(jìn)其適應(yīng)；環(huán)境的多樣化是生物多樣化的根本原因；④環(huán)境的改變會引起動物習(xí)性的改變，習(xí)性的改變會使某些器官經(jīng)常使用而得到發(fā)展，另一些器官不使用而退化；在環(huán)境影響下所發(fā)生的定向變異，即后天獲得的性狀，能夠遺傳。如果環(huán)境朝一定的方向改變，由于器官的“用進(jìn)廢退”和獲得性遺傳，微小的變異逐漸積累，終于使生物發(fā)生了進(jìn)化。拉馬克學(xué)說中的“內(nèi)在意志”帶有唯心論色彩；“后天獲得性”則多屬于“表型變異”，現(xiàn)代遺傳學(xué)已證明它是不能遺傳的。

1858年7月1日C·R·達(dá)爾文通過20多年的辛勤工作（包括5年的環(huán)球考察，20年的資料整理和構(gòu)思）終于在倫敦林奈學(xué)會上宣讀了他的關(guān)于物種起源的論文。與達(dá)爾文同時宣讀的另一篇結(jié)論相同的論文是由一位研究馬來群島動植物的學(xué)者A．R．華萊士提出的。后人稱他們的自然選擇學(xué)說為達(dá)爾文-華萊士學(xué)說。達(dá)爾文在1859年出版的《物種起源》一書中系統(tǒng)地闡述了他的進(jìn)化學(xué)說。其核心自然選擇原理的大意如下：生物都有繁殖過剩的傾向，而生存空間和食物是有限的，所以生物必須“為生存而斗爭”。在同一種群（群體）中的個體存在著變異，那些具有能適應(yīng)環(huán)境的有利變異的個體將存活下來，并繁殖后代，不具有有利變異的個體就被淘汰。如果自然條件的變化是有方向的，則在歷史過程中，經(jīng)過長期的自然選擇，微小的變異就得到積累而成為顯著的變異。由此可能導(dǎo)致亞種和新種的形成。

達(dá)爾文的進(jìn)化理論，從生物與環(huán)境相互作用的觀點出發(fā)，認(rèn)為生物的變異、遺傳和自然選擇作用能導(dǎo)致生物的適應(yīng)性改變。它由于有充分的科學(xué)事實作根據(jù)，所以能經(jīng)受住時間的考驗，百余年來在學(xué)術(shù)界產(chǎn)生了深遠(yuǎn)的影響。但達(dá)爾文的進(jìn)化理論還存在著若干明顯的弱點。一是他的自然選擇原理是建立在當(dāng)時流行的“融合遺傳”假說之上的。按照“融合遺傳”的概念，父、母親體的遺傳物質(zhì)可以象血液那樣發(fā)生融合；這樣任何新產(chǎn)生的變異經(jīng)過若干世代的融合就會消失，變異又怎能積累、自然選擇又怎能發(fā)揮作用呢？二是達(dá)爾文過分強(qiáng)調(diào)了生物進(jìn)化的漸變性；他深信“自然界無跳躍”，用“中間類型絕滅”和“化石紀(jì)錄不全”來解釋古生物資料所顯示的“跳躍性”進(jìn)化。他的這種觀點近年正越來越受到“間斷平衡論”者和“新災(zāi)變論”者的猛烈批評。

早在 1865年奧地利植物學(xué)家G·J·孟德爾就從豌豆的雜交實驗中得出了顆粒遺傳的正確結(jié)論。他證明遺傳物質(zhì)不融合，在繁殖傳代的過程中，可以發(fā)生分離和重新組合。20世紀(jì)初遺傳學(xué)建立，T．H．摩爾根等人進(jìn)而建立了染色體遺傳學(xué)說，全面揭示了遺傳的基本規(guī)律。這本應(yīng)彌補達(dá)爾文學(xué)說的缺陷，有助于進(jìn)化論的發(fā)展；但當(dāng)時大多數(shù)遺傳學(xué)家（包括摩爾根在內(nèi)），都反對達(dá)爾文的自然選擇學(xué)說。人們對達(dá)爾文進(jìn)化論的信仰，發(fā)生了“嚴(yán)重的危機(jī)”。

①

與

②現(xiàn)代綜合進(jìn)化學(xué)說

③

和間斷平衡論

1972年N．埃爾德雷奇和S．J．古爾德共同提出“間斷平衡”的進(jìn)化模式來解釋古生物進(jìn)化中的明顯的不連續(xù)性和跳躍性，認(rèn)為基于自然選擇作用的種以下的漸進(jìn)進(jìn)化模式，即線系漸變模式，不能解釋種以上的分類單元的起源，反對“現(xiàn)代達(dá)爾文主義”的“唯漸進(jìn)進(jìn)化”觀點。目前爭論仍在繼續(xù)中。

小進(jìn)化與大進(jìn)化

早在20世紀(jì)40年代，美國遺傳學(xué)家R．B．戈德施米特就認(rèn)為，通常的自然選擇，只能在物種的范圍內(nèi)，作用于基因而產(chǎn)生小的進(jìn)化改變，即小進(jìn)化；而“進(jìn)化中的決定性步驟、走向大進(jìn)化的第一步、由一個種變?yōu)榱硪粋€種的進(jìn)化步驟則需要另一種進(jìn)化方式，而不是靠微小突變的積累”。戈德施米特所提出的“大進(jìn)化”方式，就是通過他所假設(shè)的“系統(tǒng)突變”（涉及整個染色體組的遺傳突變）而產(chǎn)生所謂“有希望的怪物”，可能偶然遇到合適的小生境，從而能立足并繁衍下去。這樣就可以一下子產(chǎn)生出一個新種、甚至一個新屬或新科。

后來，美國古生物學(xué)家G．G．辛普森同意把進(jìn)化的研究分成兩大領(lǐng)域：研究種以下的進(jìn)化改變的“小進(jìn)化”和研究種以上層次的進(jìn)化的“大進(jìn)化”。辛普森雖然接受了戈德施米特的“小進(jìn)化”與“大進(jìn)化”的名稱，但并不同意戈氏的觀點，他并不認(rèn)為“小進(jìn)化”與“大進(jìn)化”是各自不同的或彼此無關(guān)的進(jìn)化方式。在辛普森看來，生物學(xué)家主要是研究種以下的現(xiàn)生生物群體的小尺度的進(jìn)化，即小進(jìn)化，而古生物學(xué)家則主要以化石為對象研究種以上的分類單元在地質(zhì)時間尺度上的進(jìn)化，即大進(jìn)化。后來的學(xué)者有的接受戈德施米特的概念，有的則贊同辛普森的看法，還有的則將兩種概念調(diào)和起來。

小進(jìn)化研究種以下的進(jìn)化改變，包括：①小進(jìn)化的因素和機(jī)制，研究遺傳突變、自然選擇、隨機(jī)現(xiàn)象（如遺傳漂變）等因素如何在個體和群體的層次上起作用，以及如何引起群體的遺傳組成的改變等。②種形成，研究新種的形成方式和過程，研究小進(jìn)化因素如何導(dǎo)致同種的群體之間的隔離的形成和發(fā)展，研究種內(nèi)分化和由亞種、半種到完全的種的發(fā)展過程等。

大進(jìn)化研究種以上的分類單元在地質(zhì)時間尺度上的進(jìn)化改變，其對象主要是化石，最小研究單位是種。主要研究內(nèi)容包括：①種及種以上分類單元的起源和大進(jìn)化的因素；②進(jìn)化型式，在時間向度上進(jìn)化的線系的變化和形態(tài)；③進(jìn)化速度，形態(tài)改變的速度和分類單元的產(chǎn)生或絕滅速度，種的壽命等；④進(jìn)化的方向和趨勢；⑤絕滅的規(guī)律、原因及其與進(jìn)化趨勢、速度的關(guān)系等。

小進(jìn)化與大進(jìn)化在物種這一層次上相互銜接，事實上小進(jìn)化與大進(jìn)化都研究物種形成。關(guān)于小進(jìn)化與大進(jìn)化的關(guān)系問題，近年學(xué)術(shù)界展開了激烈的爭論。間斷平衡學(xué)派認(rèn)為不能以小進(jìn)化的機(jī)制來解釋大進(jìn)化的事實；而現(xiàn)代綜合進(jìn)化論則認(rèn)為小進(jìn)化是大進(jìn)化的基礎(chǔ)，小進(jìn)化的機(jī)制在一定程度上是可以說明大進(jìn)化的現(xiàn)象的。

進(jìn)化型式

從進(jìn)化的觀點看，同時生存的不同生物種在時間的向度上可以回溯到一個共同祖先。因此，按照祖裔關(guān)系可以將現(xiàn)時生存的和曾經(jīng)生存過的生物相互聯(lián)結(jié)起來，這種表示祖裔關(guān)系的生物進(jìn)化系統(tǒng)稱為種系發(fā)生。生物的種系發(fā)生可以形象地表示為一顆樹：如果從樹根到樹頂代表時間向度，主干代表共同祖先，大小分枝代表相互關(guān)聯(lián)的進(jìn)化線系，這就構(gòu)成所謂種系發(fā)生樹或進(jìn)化樹。所謂進(jìn)化型式就是進(jìn)化在時間與空間上的特征，也就是種系發(fā)生的特征，具體表現(xiàn)在進(jìn)化樹的形態(tài)上：枝干的延續(xù)和分枝方式、樹干的傾斜方向和在空間上的配置、樹干的中斷等等，它代表著種系發(fā)生中線系進(jìn)化、種形成、絕滅等方面的特征。

進(jìn)化樹或種系發(fā)生樹是研究者根據(jù)各方面的資料綜合推理而構(gòu)想出來的，由于研究者所掌握的資料不同、觀點不同、構(gòu)造出來的進(jìn)化樹的形態(tài)也不盡相同。因此，關(guān)于進(jìn)化型式常常有不同觀點的爭論。種系發(fā)生是進(jìn)化生物學(xué)家與分類學(xué)家共同關(guān)心的，古生物學(xué)家和生物分類學(xué)家對進(jìn)化型式的研究貢獻(xiàn)最多。

如果以時間（通常是地質(zhì)時間）為縱坐標(biāo)，進(jìn)化改變?yōu)闄M坐標(biāo)，則在這個坐標(biāo)系中一個瞬時存在的生物相當(dāng)于一個點，一個世代延續(xù)的種則在坐標(biāo)系中相當(dāng)于一條由下向上延伸的線，這個代表種在時間向度上延續(xù)的線就叫線系。在一個線系之內(nèi)發(fā)生的進(jìn)化改變稱為線系進(jìn)化，表現(xiàn)為線系在“時間-進(jìn)化改變”坐標(biāo)系中朝某一方向傾斜，傾斜度代表該線系的進(jìn)化速度。如果一個種由線系進(jìn)化所造成的形態(tài)學(xué)改變足以構(gòu)成不同于原來種的分類單元，在古生物學(xué)上稱為時間種。古生物學(xué)家往往為了使化石分類與相應(yīng)的地層劃分相配合而把一個線系由下而上地劃分出若干個相繼的、漸變的時間種。一個線系在某一地質(zhì)時間終止，叫做絕滅，它意味著一個種的延續(xù)中斷，也就是沒有留下直接的后裔。在一個線系之內(nèi)，由一個時間種過渡為相繼的另一時間種時，前一個時間種的終止并不意味著真正的延續(xù)中斷或絕滅，在古生學(xué)上稱為假絕滅。假絕滅是人為的。在一個生物種之內(nèi)分化出新種從而造成線系的分枝，叫做種形成。關(guān)于種形成的定義存在著不同的意見，有些學(xué)者認(rèn)為種形成等于線系分枝，另一些學(xué)者認(rèn)為種形成不一定伴隨線系分枝。由同一條線系分枝出來的若干線系合起來稱為線系叢。通常所說的譜系進(jìn)化或種系發(fā)生就是指若干相關(guān)的線系的進(jìn)化，線系進(jìn)化則指一個線系之內(nèi)的進(jìn)化（圖1）。

在譜系進(jìn)化中有兩種性質(zhì)不同的進(jìn)化改變。一是形態(tài)結(jié)構(gòu)及其功能由簡單、相對不完善到復(fù)雜和相對完善的前進(jìn)性（進(jìn)步的）改變，稱之為前進(jìn)進(jìn)化；前進(jìn)進(jìn)化的結(jié)果是造成生物的等級從低級到高級。另一種進(jìn)化改變是線系分枝，叫做分枝進(jìn)化；分枝進(jìn)化的結(jié)果是產(chǎn)生新的分類單元和生物歧異度的增長。廣義的前進(jìn)進(jìn)化包括除分枝進(jìn)化以外的各種進(jìn)化改變，既包括前進(jìn)的（進(jìn)步的）進(jìn)化改變，也包括非前進(jìn)的甚至退化的改變。既無前進(jìn)進(jìn)化，又無分枝進(jìn)化的情況稱為停滯進(jìn)化，如“活化石”之類的情況）。

在相對較短的地質(zhì)時間內(nèi)，從一個線系分枝出許多歧異的分類單元，叫做輻射。由于輻射分枝產(chǎn)生的新分類群通常是向不同的方向適應(yīng)進(jìn)化的（新分類群之間有較大的歧異），所以又稱為適應(yīng)輻射。在種系發(fā)生圖上適應(yīng)輻射表現(xiàn)為密集的線系叢。在分類學(xué)上，一個線系叢往往代表種以上的分類單元?？梢哉f：種以上的分類單元往往是通過適應(yīng)輻射而“快速”產(chǎn)生的。例如：①后生無脊椎動物最早的適應(yīng)輻射發(fā)生在前寒武紀(jì)之末，大約6.5～7億年前；多種多樣的無骨骼的軟軀體動物印痕化石在世界各大陸的若干地方差不多同一時期的地層中都有發(fā)現(xiàn)，其中以澳大利亞的伊迪卡拉動物群為最典型。②在寒武紀(jì)一開始，許多有外骨骼的無脊椎動物化石（包括現(xiàn)生的無脊椎動物各門的祖先），在世界各地差不多同時（5.7～6億年前）的地層中出現(xiàn)。由于眾多的門類在較短的地質(zhì)時間內(nèi)（2000～3000萬年期間）“突然”產(chǎn)生出來，有的古生物學(xué)家（如古爾德）稱之為“寒武爆發(fā)”。③寒武紀(jì)以后的無脊椎動物又經(jīng)歷過幾次規(guī)模較小的適應(yīng)輻射。例如在早寒武世三葉蟲第一次出現(xiàn)后的1500～3000萬年間，一共有30個科的三葉蟲產(chǎn)生出來；二疊紀(jì)末菊石幾乎全部絕滅后，到了三疊紀(jì)初期的700～800萬年間又產(chǎn)生出許多新科；在侏羅紀(jì)早期2000萬年間產(chǎn)生出六射珊瑚的6個超科。④在早白堊世大約1000萬年間產(chǎn)生出顯花植物的許多科。⑤大部分哺乳動物的“目”是在白堊紀(jì)末到第三紀(jì)初很快產(chǎn)生出來的。

不同的線系各自獨立地進(jìn)化出相似的特征叫做趨同進(jìn)化，簡稱趨同。形態(tài)結(jié)構(gòu)的進(jìn)化趨同往往是由于功能的相似，而功能的相似又往往是由于適應(yīng)于相似的環(huán)境。趨同進(jìn)化的結(jié)果是產(chǎn)生功能相同或相似的形態(tài)結(jié)構(gòu)，在比較解剖學(xué)上叫做同功。與此相對，由于有共同祖先而造成的形態(tài)結(jié)構(gòu)的相似叫做同源。例如鳥、蝙蝠和昆蟲的翅屬于同功器官，它們祖先各自獨立地進(jìn)化出適應(yīng)于飛翔的翅，這些翅可以說是趨同進(jìn)化的結(jié)果。人的手、鯨的鰭、鳥的翅和馬的前肢等則屬同源器官，是共同祖先經(jīng)過長期適應(yīng)輻射的結(jié)果。

是指兩個或多個有共同祖先的線系，在其祖先遺傳的基礎(chǔ)上分別獨立進(jìn)化出相似的特征。通常平行與趨同不易區(qū)分，一般說來平行進(jìn)化既涉及同功又涉及同源；假若后裔間的相似程度大于各自的祖先之間的相似程度則可稱為趨同，若后裔之間的相似程度與其祖先之間的相似程度差不多則可稱為平行。

影響進(jìn)化型式（進(jìn)化樹的形態(tài)）的兩個最主要的因素是形態(tài)進(jìn)化速度和種形成（線系分枝）。進(jìn)化的改變（指形態(tài)學(xué)的改變）也相應(yīng)地包含兩個分量，即由線系進(jìn)化產(chǎn)生的線系進(jìn)化分量和由線系分枝產(chǎn)生的種形成分量。代表兩種對立觀點的兩種大進(jìn)化模式之間的主要差別就在于分別強(qiáng)調(diào)兩個分量中的一方面。①漸變模式：認(rèn)為形態(tài)進(jìn)化速度多少是恒定的、勻速的，形態(tài)進(jìn)化是漸近的；形態(tài)改變主要是線系進(jìn)化造成的，大多發(fā)生在種的生存期間，與種形成無關(guān)，種形成（線系分枝）本身只是增加新的進(jìn)化方向；②間斷模式：認(rèn)為形態(tài)進(jìn)化速度是不恒定、非勻速的，快速的“跳躍”與長期的停頓相交替，即在種形成期間進(jìn)化加速，種形成后保持相對的穩(wěn)定。進(jìn)化的形態(tài)改變與種形成相關(guān)聯(lián)，即大部分形態(tài)改變是發(fā)生在相對較短的種形成時期，在可能長達(dá)數(shù)百萬年的種生存期內(nèi)不會發(fā)生顯著的形態(tài)改變）。間斷模式或間斷平衡論是N．埃爾德雷奇和S．J．古爾德于1972年正式提出的（N．埃爾德雷奇和古爾德，1972），之所以稱之為“間斷平衡”是為了強(qiáng)調(diào)大進(jìn)化的“間斷”的特征，即進(jìn)化在種形成時加速，種形成后又保持穩(wěn)定的平衡。

漸變論是達(dá)爾文以來多數(shù)進(jìn)化學(xué)者（包括現(xiàn)代綜合論者）的傳統(tǒng)觀點?，F(xiàn)代綜合論的先驅(qū)者之一J．S．赫胥黎認(rèn)為，自然選擇造成的進(jìn)化一般說來并不隨種形成而加速，大多數(shù)種形成是偶然事件，線系進(jìn)化才是進(jìn)化的主流。這是典型的線系漸變論觀點。間斷論的一些基本觀點（如快速的種形成，進(jìn)化的“跳躍”等）可以追溯到20世紀(jì)早期。H．德·弗里斯，1905年引用物理學(xué)家W．T．開爾文所計算的地球年齡（不超過2000～4000萬年）而推論說，種形成不可能象達(dá)爾文所描述的那樣緩慢，在如此短的時間（當(dāng)然開爾文的計算是錯誤的，現(xiàn)代同位素方法測得的地球年齡是46.5億年）中，種形成必定是大的突變。戈德施米特提出的高級分類單元可以通過染色體“系統(tǒng)突變”而迅速產(chǎn)生的看法也接近于現(xiàn)代間斷論的觀點。甚至現(xiàn)代綜合論的先驅(qū)者也都不同程度地強(qiáng)調(diào)過種形成過程的“跳躍”特征。例如賴特（1940）認(rèn)為大物種的小群體進(jìn)化速率特別高，有可能形成新種；辛普森提出的“量子進(jìn)化”，也強(qiáng)調(diào)了種形成的跳躍形式。E．邁爾（1954）是最早提出“間斷進(jìn)化”觀點的，他認(rèn)為當(dāng)新種從老種的一個隔離的小群體中產(chǎn)生出來時，常常伴隨著快速的進(jìn)化歧異。他還用這個觀點解釋了化石記錄所顯示的進(jìn)化“鴻溝”。快速的形態(tài)進(jìn)化繼之以長時期的形態(tài)穩(wěn)定，這樣的實例見之于化石記錄；但也有不少實例表明形態(tài)進(jìn)化似乎是在一個線系內(nèi)發(fā)生的。究竟哪一種模式是正確的，目前還不能作出判斷，對同樣的資料（例如同樣的化石記錄）往往可以有不同的解釋。

總體說來，漸變論和間斷論在解釋大進(jìn)化的過程時所強(qiáng)調(diào)的方面不同。漸變論或漸變模式強(qiáng)調(diào)進(jìn)化過程的連續(xù)和勻速，強(qiáng)調(diào)線系進(jìn)化對總的形態(tài)進(jìn)化改變量的貢獻(xiàn)，強(qiáng)調(diào)種內(nèi)的小進(jìn)化過程中變異的積累，主張自然選擇是進(jìn)化的主要因素。而間斷平衡論或間斷平衡模式則幾乎相反：強(qiáng)調(diào)進(jìn)化過程的不勻速，強(qiáng)調(diào)種形成事件對形態(tài)進(jìn)化改變量的貢獻(xiàn)，強(qiáng)調(diào)小群體內(nèi)的隨機(jī)事件、強(qiáng)調(diào)大的突變、強(qiáng)調(diào)物種選擇或環(huán)境突變對大進(jìn)化的作用。雙方各有一些有利于自己的證據(jù)，當(dāng)然這些證據(jù)本身還需進(jìn)一步研究才能證實。

有利于間斷平衡論的證據(jù)有：①古生物的高級分類階元在相對較短的地質(zhì)時間內(nèi)快速出現(xiàn)（同時伴隨高級分類階元的快速絕滅）。在前寒武紀(jì)末到早寒武紀(jì)的無脊椎動物高級分類群的“快速”出現(xiàn)被形容為“寒武爆發(fā)”；在早寒武世的1500～2000萬年期間產(chǎn)生了三葉蟲的30個科；在二疊紀(jì)末菊石大量絕滅之后，到三疊紀(jì)的最初800萬年期間又從少數(shù)物種中產(chǎn)生出好幾個新科；侏羅紀(jì)初的2000萬年期間產(chǎn)生了六射珊瑚6個超科；哺乳類的許多目是在中生代末、新生代初的較短時間內(nèi)出現(xiàn)的；根據(jù)化石記錄測算的某些古生物門類的進(jìn)化速度是不均勻的，在適應(yīng)輻射期間進(jìn)化加速。②某些現(xiàn)代生物快速種形成。以東非維多利亞盆地湖泊區(qū)的麗魚科的“爆發(fā)式的種形成”為例，據(jù)研究維多利亞盆地的眾多湖泊形成于75～180萬年前，在這些湖泊中生存著500種以上的麗魚，種數(shù)占該科的一半以上。這些麗魚分布于各個小的湖盆地，地方化很強(qiáng)，每個湖盆也有一個特有的物種群。學(xué)者們認(rèn)為這一地區(qū)的500種以上的麗魚是在75～180萬年期間由少數(shù)麗魚祖先快速輻射進(jìn)化而產(chǎn)生的。這說明，雖然在一般情況下形態(tài)學(xué)進(jìn)化速度和分枝進(jìn)化速度都很緩慢，但在某些合適的環(huán)境條件下，進(jìn)化速度很高。③某些形態(tài)結(jié)構(gòu)的進(jìn)化不可能有中間過渡階段，只能是跳躍的。例如腹足類的內(nèi)臟的扭轉(zhuǎn)不可能有中間形態(tài)，因為任何中間形態(tài)都不適應(yīng)生存。內(nèi)臟要么經(jīng)過180°扭轉(zhuǎn)而使鰓和肛門等轉(zhuǎn)向頭部（前鰓亞綱），要么再經(jīng)過180°反扭轉(zhuǎn)而使鰓和肛門回到后部（后鰓亞綱）。④某些遺傳學(xué)的證據(jù)支持高級分類單元的跳躍式地產(chǎn)生的假說。例如高等植物的染色體基數(shù)往往在較高級的分類群中是恒定的。在木本植物中同一科的植物種往往有相同的染色體基數(shù)。草本植物中同一屬的植物往往有相同的染色體基數(shù)。因此，學(xué)者們認(rèn)為，植物的染色體基數(shù)的改變造成一個新屬或一個新科，這無疑是進(jìn)化跳躍。

與此相反，另外一些事實支持漸變論或漸變進(jìn)化模式：①在自然界中有不完全種（亞種、半種）以及其他有種內(nèi)分異的復(fù)合種（即包含有族、亞種等種下單元的種）的存在說明種形成是通過若干中間階段的漸進(jìn)過程。②協(xié)進(jìn)化，在生態(tài)上密切相關(guān)的（或相互依賴的）物種（例如昆蟲或蜂鳥與植物的花，寄生的動物與寄主等）的協(xié)同進(jìn)化不可能采取跳躍的形式。例如蜂鳥的喙的長度形狀與其采集花蜜的花的形態(tài)結(jié)構(gòu)極為吻合。任何一方的突然的、大的變異都不利于雙方。③復(fù)雜器官（例如眼）的進(jìn)化涉及許多相關(guān)的結(jié)構(gòu)與機(jī)能的協(xié)調(diào)，因而也不大可能采取跳躍的形式。④重新測算線系進(jìn)化速度后得出結(jié)論認(rèn)為線系進(jìn)化速度足夠大，可以解釋大進(jìn)化的高級分類單元的快速產(chǎn)生。

進(jìn)化速率

單位時間內(nèi)生物進(jìn)化改變量。衡量進(jìn)化速率必須確定兩個尺度：時間尺度和進(jìn)化改變量的尺度。時間尺度有兩種，即絕對地質(zhì)時間（根據(jù)同位素方法測定的地質(zhì)時間）和相對地質(zhì)時間（由于地質(zhì)年代單位并非等時距，因此在可能的條件下應(yīng)使用絕對時間尺度；只在不得已時，才使用相對時間尺度）。

進(jìn)化改變量的衡量比較復(fù)雜，通常也應(yīng)用兩種尺度：①形態(tài)學(xué)尺度，即以形態(tài)改變量為衡量尺度。通常用的是體積、長、寬、角度等可測量的數(shù)量性狀的測量值的變化。②分類學(xué)尺度，即以分類單元（種、屬、科等）產(chǎn)生的數(shù)目為衡量尺度。

相應(yīng)于上述兩種衡量尺度而有兩種不同的進(jìn)化速率：①形態(tài)學(xué)進(jìn)化速率單位時間內(nèi)形態(tài)改變量；形態(tài)改變量/時間（百萬年）。通常以百萬年為時間單位，形態(tài)改變量可以直接用測量的單位，也可以將不同的測量單位換算為某種統(tǒng)一的單位。②分類學(xué)進(jìn)化速率——單位時間內(nèi)新分類單元（種、屬、科等）產(chǎn)生的數(shù)目：新分類單元產(chǎn)生數(shù)目/單位時間（百萬年）新分類單元產(chǎn)生的情況比較復(fù)雜。新分類單元既包括線系進(jìn)化產(chǎn)生的時間種，也包括分枝種形成產(chǎn)生的新分類單元。因此，又可以區(qū)分出兩種情況和兩種分類學(xué)進(jìn)化速率：假定所研究的化石材料可以證明是同一線系的，則可計算出某一地質(zhì)時間內(nèi)的線系進(jìn)化速率，即單位時間內(nèi)時間種的產(chǎn)生數(shù)目：線系進(jìn)化速率=時間種數(shù)目/時間（百萬年）。如果在時間種的分類上有大致相同的形態(tài)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)，則線系進(jìn)化速率相當(dāng)于線系內(nèi)的形態(tài)學(xué)進(jìn)化速率。假定研究的化石材料屬于相關(guān)的不同線系，則可以計算出某一地質(zhì)時間內(nèi)種形成的速率，或分支進(jìn)化速率：種形成速率=分枝（種形成）事件數(shù)目/時間（百萬年）不同觀點的研究者在研究進(jìn)化速率時，往往有所側(cè)重。漸變論者常側(cè)重于線系進(jìn)化速率的研究。但要獲得同一線系的完整的化石材料是不容易的。有時因材料不能確證為同一線系，其研究成果也受懷疑。間斷論者則更重視分枝種形成速率的研究。

通常用“時間種”的壽命來測定線系進(jìn)化速率。“時間種”可以看作是線系進(jìn)化的片段。因為時間種代表綜合的形態(tài)變量的測定，同時在某些情況下“時間種”的壽命是可以測量出來的。所以用“時間種”為進(jìn)化改變量的單位是合適的。某一“時間種”在線系進(jìn)化中的形態(tài)改變達(dá)到另一個“新時間種”之前所持續(xù)的那段時間就是該“時間種”的壽命?！皶r間種”的壽命是可以測量的。G．G．辛普森在研究上新世到更新世的哺乳動物進(jìn)化速度時曾用所謂“分類學(xué)生存曲線”的方法。由于“時間種”的壽命反映了線系進(jìn)化速率（時間種壽命愈短，線系進(jìn)化速率越高），所以我們可以用“時間種”壽命的倒數(shù)作為線系進(jìn)化速率的測量：

線系進(jìn)化速率=1/時間種壽命

例如一個壽命為200萬年的時間種的線系進(jìn)化速率可以表示為0.5“時間種”/百萬年，即每百萬年產(chǎn)生0.5個“時間種”。如果以大致相同的形態(tài)學(xué)標(biāo)準(zhǔn)來劃分“時間種”，則以“時間種”壽命的倒數(shù)作為線系進(jìn)化速率的測量是比較準(zhǔn)確的。但是用這樣的方法所測定的某些動物化石的線系進(jìn)化速率都比較低，例如歐洲上新世至更新世哺乳動物平均線系進(jìn)化速率為1.1“時間種”/百萬年，極少數(shù)達(dá)到4“時間種”/百萬年，只有1%的線系達(dá)到2.9“時間種”/百萬年。用類似的方法測出的人類線系進(jìn)化速率比哺乳動物平均進(jìn)化速率還低。海洋無脊椎動物線系進(jìn)化速率的測量結(jié)果數(shù)值也很低，例如腕足類的準(zhǔn)小石燕貝科中的大多數(shù)種的壽命都超過了百萬年，線系進(jìn)化速率在0.3～0.4“時間種”/百萬年以下。以這樣的低的線系進(jìn)化速率很難解釋大進(jìn)化，例如歐洲整個更新世的180萬年期間至少產(chǎn)生了15個哺乳動物新屬，只有100個線系可以作為產(chǎn)生新屬的親本，按照1.1“時間種”/百萬年的平均速率要在180萬年內(nèi)產(chǎn)生15個新屬是不可能的。

然而，正如某些研究者指出的，由于所用的時間間距長，產(chǎn)生很大的誤差（由于進(jìn)化速度不均勻、正向與逆向進(jìn)化相互抵消等，時間間距愈長，誤差愈大，測出的速率愈低），因此，依據(jù)化石資料的線系進(jìn)化速率的測量，仍然存在許多問題。

如果承認(rèn)快速進(jìn)化發(fā)生于種形成（線系分枝）期間，或者說種形成是進(jìn)化加速的位點，那么測定種形成速率是了解進(jìn)化特征的重要手段。絕滅是進(jìn)化的另一個側(cè)面，而且種形成速率與絕滅速率相互關(guān)聯(lián)。種形成速率的測定可通過下面的步驟：首先求出物種凈增率（R），其次求出絕滅速率（E），最后求出種形成速率（S）。三者的關(guān)系是：

S=R+E

物種凈增率——種形成過程中物種數(shù)目的增長是指數(shù)增長，這和生物群體的個體數(shù)目增長相似。在測定物種數(shù)目的增長時要考慮初始物種數(shù)目（基數(shù)），換句話說物種凈增率是單位時間內(nèi)物種數(shù)目的相對增長。用公式表示則為：

DN/Dt=RN

公式中N代表物種數(shù)目，t代表時間，R就是物種凈增率，將上式積分則得：

N=N0eRt

公式中N0代表初始物種數(shù)目，e是自然對數(shù)的底。如果已知初始物種數(shù)N0和終末物種數(shù)N、以及時間t，則可求出R。可將上式變化，得：

lnN=lnN0eRt

lnN=lnN0+lneRt

lnN=lnN0+Rt

R的單位是“百萬年-1”。

對于不同分類群的R值的計算結(jié)果表明各個大分類群的R值很不相同，而同一大分類群中的成員具有相近的R值。實際上種形成過程中物種數(shù)目的增長（歧異度的增長）不可能一直遵循指數(shù)增長方式。適應(yīng)輻射期間的物種數(shù)目的增長曲線與純指數(shù)增長曲線不一樣，前者是“衰變”式的；開始是指數(shù)增長，然后增長減緩，曲線向下彎曲?？梢杂妹枋龇派湫运プ兊念愃品椒▉砻枋鲞m應(yīng)輻射期間物種數(shù)目的增長。但放射性衰變指數(shù)是負(fù)的，這里是正指數(shù)。所以不用“半衰期”，而用種形成“雙倍時間”來表示不同分類群的種數(shù)目增長特點。當(dāng)N/N0=2時，

t2=ln2/R

公式中t2就是“雙倍時間”，即種數(shù)增長一倍所需時間。雙倍時間根據(jù)R值求出，例如哺乳類平均R值為0.22百萬年-1，則雙倍時間為t2=ln2/0.22=3.15百萬年。

絕滅速率——根據(jù)化石資料可以計算出絕滅速率。但通常所計算的絕滅包含了真絕滅和假絕滅。實際上二者不易區(qū)分，在一般情況下可以先求出總絕滅速率，假絕滅速率可以估計，三者的關(guān)系是

E=E′－e

公式中E代表真絕滅速率，E′代表總絕滅速率，e代表假絕滅速率?？偨^滅速率可以通過某些間接方法求出。D．M．勞普和W．M．斯坦利曾提出一種方法（1978）其原理是通過測定線系或物種的壽命來求絕滅速率。先假定是簡單的情況：設(shè)想一組線系，它們的壽命相等，譬如說每個線系都生存500萬年。又假定每100萬年期間有5個線系同時存在，每100萬年絕滅一個線系（即總數(shù)的1/5）。在這種情況下，絕滅速率可表示為線系壽命的倒數(shù)，即

1/500萬年=0.2×100萬年^-1

這就是說一個壽命為500萬年的線系（或物種），每100萬年絕滅1/5。如果一組線系（或物種）的各成員壽命不等，就可以用適當(dāng)?shù)姆椒ㄇ蟪銎骄鶋勖推骄^滅速率。所謂適當(dāng)方法就是能夠盡量消除時距所造成的誤差。為此，應(yīng)以某一瞬時存在的線系或物種的個別絕滅速率來求出總平均絕滅速率，而不能用某一段時間生存的線系或物種來平均。壽命長的物種在某一瞬時存在的概率比壽命短的物種要大，瞬時存在的概率與物種壽命成正比。

例如，假設(shè)在600萬年期間有11個物種生存，其中壽命為100萬年者有6個，200萬年者有3個，300萬年者有2個。由此可以畫出在600萬年期間不同壽命的物種的柱狀分布圖。如果我們以600萬年期間生存的11個物種的平均壽命來求平均絕滅速率，顯然其結(jié)果會偏高，因為我們把壽命短的與壽命長的物種同等看待了。更好的方法是求出每一瞬時（圖7中的T）存在的物種數(shù)目。求法是將不同壽命的物種數(shù)目乘以各自的瞬時存在的概率。壽命為100萬年的瞬時存在概率為1/6，壽命為200萬年者為2/6，300萬年者為3/6。這樣我們就得出每一瞬時不同壽命的物種的柱狀分布圖。計算結(jié)果是不同壽命的物種每一瞬時存在的數(shù)目都是1（6×1/6=1；3×2/6=1；2×3/6=1），也就是說每一瞬時生存的物種總數(shù)為3個，其中100萬年的1個，200萬年1個，300萬年的1個。由這3個物種得出的平均壽命為200萬年，平均總絕滅速率為0.5×100萬年-1。如果這里不包含假絕滅速率（假設(shè)11個種不包含“時間種”），或假絕滅速率可以估計出來，則可以求出真絕滅速率。

種形成速率（S）由物種凈增率（R）與真絕滅速率（E）之和求得。

進(jìn)化趨勢

從長的時間尺度來看生物進(jìn)化呈某種方向性，但這并非說自然界存在著既定的進(jìn)化軌道，這里說的方向性是統(tǒng)計學(xué)的趨向。進(jìn)化是否有方向或是否定向是進(jìn)化論發(fā)展史中爭論的主要問題之一。從拉馬克的進(jìn)化梯級說（進(jìn)化=進(jìn)步）到直生說都強(qiáng)調(diào)進(jìn)化的定向性。他們認(rèn)為自然選擇控制進(jìn)化的方向，進(jìn)化是生物對環(huán)境的適應(yīng)，如果環(huán)境變化具有趨向性，則進(jìn)化也表現(xiàn)出趨向性。隨機(jī)論者是徹底否定進(jìn)化定向的。但他們并不反對進(jìn)化的趨向性，因為隨機(jī)因素也能造成進(jìn)化的統(tǒng)計學(xué)趨勢。因此，進(jìn)化趨勢是任何因素（包括隨機(jī)的非隨機(jī)的因素）所造成的進(jìn)化的統(tǒng)計學(xué)趨勢。

小進(jìn)化趨勢是指在生物種的自然群體之內(nèi)，自然選擇作用所造成的表型進(jìn)化改變的趨向性。這種進(jìn)化趨勢通常是適應(yīng)局部環(huán)境的結(jié)果，進(jìn)化改變發(fā)生在線系之內(nèi)，所以也可稱之為線系進(jìn)化趨勢，表現(xiàn)為線系在時間-進(jìn)化改變坐標(biāo)系內(nèi)的傾斜。

大進(jìn)化趨勢是指在種系發(fā)生中線系分枝的主體的趨向性。大進(jìn)化趨勢發(fā)生在種以上的分類單元的譜系進(jìn)化中，所以又可以稱為譜系進(jìn)化趨勢，表現(xiàn)為譜系中的偏斜。

①造成進(jìn)化趨勢的主要因素：表型分異和分枝分異（或譜系分異）。表型分異指一個單系群在其進(jìn)化過程中從時間t1到時間t2其平均的表型發(fā)生差異或分異（例如，在t2時的平均體積比在t1時的平均體積增大一倍），從而造成譜系的偏斜。造成表型分異的原因有二，一是線系進(jìn)化（自然選擇造成的適應(yīng)性進(jìn)化改變），二是種形成或分枝的方向。分枝分異或譜系分異指一個單系群在時間t1到t2之間物種數(shù)目的差異性增長，從而造成譜系的偏斜。物種數(shù)目的凈增長率（R）與種形成速率（S）和絕滅速率（E）有關(guān)，即R=S-E。因此，物種數(shù)目的差異性增長是由區(qū)分性的種形成速率和絕滅速率決定的。假定在某一方向的種形成（線系分枝）速率大于（或小于）另一方向的種形成速率，或某一方向的絕滅速率大于（或小于）另一方向的絕滅速率，就會造成譜系偏斜或譜系進(jìn)化趨勢。

表型分異和譜系分異是構(gòu)成大進(jìn)化趨勢的兩個分量，這兩個分量的不同組合可以造成4種情況：無進(jìn)化趨勢（圖9a無表型分異，無譜系分異）；進(jìn)化趨勢僅表現(xiàn)為表型分異；進(jìn)化趨勢僅表現(xiàn)為物種凈增率（R）的差異（或種形成速率S與絕滅速率的差異）；進(jìn)化趨勢表現(xiàn)為表型分異與種凈增率差異的結(jié)合。

上述4種情況中在第二種情況下，左、右側(cè)的物種凈增率R相等，進(jìn)化趨勢表現(xiàn)為線系進(jìn)化（向右側(cè)傾斜）造成的表型分異。在第三種情況下，不存在線系進(jìn)化，但右側(cè)的物種凈增率R大于左側(cè)的，造成譜系主體傾向于右側(cè)。在第四種情況下，線系進(jìn)化造成的表型分異和區(qū)分性物種凈增率相結(jié)合，形成右側(cè)的進(jìn)化趨勢。

物種凈增率R的差異可以由種形成速率S的差異或絕滅速率E的差異造成。例如，如果一側(cè)的S大于另一側(cè)則R值相應(yīng)地會改變；或是一側(cè)的E值低于另一側(cè)，則R值也會不同。

②為解釋大進(jìn)化趨勢發(fā)生的原因不少學(xué)者提出過種種假說，但由于缺乏證據(jù)，能夠成立或有說服力的還很少見。

其一，以小進(jìn)化趨勢（線系進(jìn)化趨勢）解釋大進(jìn)化趨勢——某些漸變論者認(rèn)為進(jìn)化改變的主要分量是線系進(jìn)化，大進(jìn)化的趨勢就是由長期穩(wěn)定的選擇壓造成的線系進(jìn)化的趨勢。所以大進(jìn)化趨勢與小進(jìn)化趨勢是一致的，造成大進(jìn)化的原因和機(jī)制與造成小進(jìn)化趨勢的相同。例如馬的進(jìn)化，他們認(rèn)為從始馬到現(xiàn)代馬是一個長的進(jìn)化線系。由于長期穩(wěn)定的選擇壓力，適應(yīng)快速奔跑的要求，馬的祖先向著增大體軀和改造足趾結(jié)構(gòu)的方向進(jìn)化。長時期的環(huán)境趨向性改變（例如氣候的趨向性改變）對生物造成穩(wěn)定的選擇壓力可能形成大進(jìn)化的趨勢。當(dāng)然不是所有的漸變論者都持有這樣的觀點。例如辛普森就認(rèn)為進(jìn)化不是完美的單線系，大進(jìn)化中包含許多線系分枝，甚至包含與大進(jìn)化趨勢相逆的分枝方向。辛普森認(rèn)為在馬的祖先始馬與現(xiàn)代馬之間的譜系很復(fù)雜，并非一條單線系。

其二，是物種選擇說——一些學(xué)者認(rèn)為，自然選擇可能在物種層次上起作用，并將小進(jìn)化機(jī)制搬用到大進(jìn)化中，例如大進(jìn)化中的物種相當(dāng)于小進(jìn)化中的生物個體，大進(jìn)化中的種形成和絕滅相當(dāng)于小進(jìn)化中的個體出生與死亡，大進(jìn)化中的“種形成”產(chǎn)生的變異相當(dāng)于小進(jìn)化中的突變和遺傳重組。由于將物種視為自然選擇的作用單位，所以稱之為物種選擇。如果承認(rèn)自然選擇在物種層次上起作用，那么大進(jìn)化趨勢必定是適應(yīng)趨勢，持這種觀點的人認(rèn)為大進(jìn)化過程中生物體制的復(fù)雜化常常包含著適應(yīng)方面的完善化趨勢，生物種之間的競爭可能造成許多進(jìn)化分枝的區(qū)分性絕滅（非隨機(jī)的絕滅），正是這種非隨機(jī)因素（區(qū)分性絕滅或淘汰）造成大進(jìn)化的適應(yīng)趨勢，或“進(jìn)步”趨勢。

有些古生物學(xué)家認(rèn)為中寒武世以后三葉蟲開始走下坡路，物種分異度下降。從結(jié)構(gòu)上分析，三葉蟲與甲殼類相比顯然處于劣勢：三葉蟲缺少強(qiáng)有力的顎、螯和頭胸甲，游泳能力也相對較弱，在與甲殼類競爭上很不利。因此，當(dāng)頭足類和魚類興盛以后三葉蟲大量絕滅，只有一部分留下來并發(fā)生了進(jìn)化改變。這種絕滅并非隨機(jī)的，那些游泳能力弱、防護(hù)能力差的種類絕滅的機(jī)會大些。種間競爭、物種選擇造成中寒武世以后三葉蟲的進(jìn)化趨勢；同時在節(jié)肢動物門這個更大的分類群范圍內(nèi)甲殼類又逐步替代了三葉蟲類。

個體層次上的自然選擇是以隨機(jī)的遺傳變異（突變和重組）和個體間繁殖機(jī)會的差異為基礎(chǔ)的。物種選擇如果存在，其前提應(yīng)當(dāng)是種形成事件的隨機(jī)性和物種的生存或絕滅機(jī)會的差異。

種形成事件發(fā)生的方向多半是偶然的。例如一個祖先種所遇到的生存環(huán)境的性質(zhì)、環(huán)境的綜合特征等等多是偶然的，一個種形成事件發(fā)生的方向，新種的變異方向是不可預(yù)測的。因此，就種形成事件總體而言，也如遺傳變異一樣具有隨機(jī)性?；涗涀C明某些類群在進(jìn)化過程中有反復(fù)的特點，稱之為徘徊進(jìn)化。例如蚶科動物既有足又有足絲，有的種營固著生活，足絲發(fā)達(dá)，足退化，但足仍保存于幼體階段；又有些種在進(jìn)化中恢復(fù)底埋生活，足又發(fā)達(dá)起來，而足絲仍保留于幼體中?？磥矸N形成事件的方向是既可前進(jìn)又可后退的。

能夠說明大進(jìn)化趨勢是適應(yīng)的具體證據(jù)并不多，但某些古生物學(xué)家認(rèn)為生物進(jìn)化中結(jié)構(gòu)復(fù)雜化和功能完善化的趨勢就是適應(yīng)的。在某一地質(zhì)時代曾經(jīng)是成功地適應(yīng)環(huán)境的種類，換了時代就未必成功了，因為又有了更適應(yīng)的種類出現(xiàn)；中生代的恐龍如果生活于現(xiàn)代未必能占據(jù)那么廣闊的生境，因為今日有更適應(yīng)的動物種類；有袋類在澳大利亞是成功的，但競爭不過哺乳類中較晚出現(xiàn)的真獸類。

關(guān)于種間競爭導(dǎo)致非隨機(jī)性絕滅的證據(jù)大多是推測性的。例如一些學(xué)者認(rèn)為捕食種（肉食性物種）的適應(yīng)輻射會導(dǎo)致被捕食種（植食性物種）的絕滅率增高；在食物鏈的位置愈高，物種之間的競爭愈烈，絕滅率愈高。非隨機(jī)性絕滅導(dǎo)致區(qū)分性的物種凈增率（R），從而引起譜系分異。

其三，譜系飄移說——某些學(xué)者，例如D．M．勞普、古爾德（1974）用計算機(jī)模擬來證明隨機(jī)因素對進(jìn)化譜系趨勢的影響。正如在小群體中的遺傳漂變能造成小群體對群體總體的大的偏離一樣，在小的分枝叢中隨機(jī)因素（隨機(jī)的種形成和隨機(jī)的絕滅）也會造成譜系的顯著的偏斜（譜系趨勢），這叫做譜系飄移。這方面的實際證據(jù)還沒有，只是停留在數(shù)學(xué)方法的推理上。

其四，效應(yīng)假說——E．S．弗爾巴提出的大進(jìn)化趨勢發(fā)生原因的另一種解釋是：進(jìn)化趨勢可能是生物種內(nèi)在的過程和特征的非自然選擇的效應(yīng)，他稱之為效應(yīng)假說。這個假說認(rèn)為，雖然種形成事件發(fā)生的方向（進(jìn)化改變的方向）是隨機(jī)的，但不同物種或不同線系可能具有不同的種形成幾率；種以下的自然選擇造成的適應(yīng)特征有可能影響或決定不同物種的特有的種形成幾率；簡言之，不同的物種或線系具有不同的形成新種（分枝）的潛力或可能性。而差異性的種形成就會導(dǎo)致大進(jìn)化趨勢。小進(jìn)化過程造成的適應(yīng)性狀可能影響種形成速率S，也間接地影響到絕滅速率E。不同的S與E造成區(qū)分性的R，從而造成譜系分異。如廣適性的種與狹適性的種在變化的環(huán)境條件下，種形成與絕滅速率明顯不同。廣適性、廣布的種在改變了的環(huán)境條件下仍能較好地適應(yīng)，受到的選擇壓較低，S和E增高不顯著；反之，狹適性、特化的種在改變了的環(huán)境條件下，受到的選擇壓較高，S和E也可能升高。